Les causes courantes de contamination des aliments comprennent les bactéries, les virus et les parasites entrant dans le processus de production pendant la phase de croissance, de récolte, de transformation, d'expédition ou de préparation. Les aliments particulièrement susceptibles d'être contaminés sont les aliments crus et prêts à l'emploi. -des aliments à manger, tels que des fruits et légumes, qui ne sont pas cuits avant d'être consommés.
E. coli est l'un des contaminants les plus courants et est le résultat d'un bœuf insuffisamment cuit qui a été contaminé par des excréments lors de son abattage. La contamination croisée des aliments par la salmonelle est courante dans les cuisines où les cuisiniers manipulent de la viande et de la volaille crues à l'aide d'outils ou de mains non lavées qui manipulent également des aliments cuits ou prêts à manger, entraînant une intoxication alimentaire pour le consommateur.