Les raisins rouges sont en fait plus sains que les raisins verts car ils ont une teneur plus élevée en flavonoïdes et sont donc plus riches en antioxydants que les raisins verts. Les flavonoïdes se regroupent dans la peau plus foncée du raisin rouge.
Les raisins rouges contiennent de la quercétine, un flavonoïde qui possède des propriétés anti-inflammatoires et antihistaminiques et aide le système immunitaire à combattre les allergies. Ils contiennent également du resvératrol, un flavonoïde ayant des similitudes avec les œstrogènes synthétiques qui peut aider à soulager les symptômes de la ménopause. Les catéchines, les proanthocyanidines et les stilbènes contenus dans les raisins rouges peuvent également avoir un effet préventif contre le cancer du sein. Les raisins rouges et verts contiennent de grandes quantités de manganèse, qui renforce les os et les tissus conjonctifs.