Les noyaux d'avocat ne sont pas toxiques pour les humains en petites quantités, mais ils contiennent une toxine fongicide appelée persine qui peut nuire aux animaux domestiques. La persine est un composé soluble dans l'huile présent dans les feuilles, l'écorce et noyaux d'avocats.
Les feuilles et les graines d'avocat sont nocives lorsqu'elles sont ingérées en grande quantité, mais en 2014, peu de cas de toxicité ont été signalés. Les noyaux d'avocat sont particulièrement toxiques pour les chevaux, les bovins, les chèvres et les oiseaux. Les chats et les chiens présentent de légers signes de maladie après avoir mangé de grandes quantités de chair et de pelures d'avocat, et manger les noyaux peut provoquer une obstruction gastrique. Bien qu'une certaine persine s'infiltre dans la chair des avocats à partir des noyaux et des peaux, la concentration a tendance à être faible. Les personnes allergiques au latex, à la banane, au melon et à la pêche peuvent être allergiques aux avocats.
