Presque tous les fromages disponibles à l'achat dans les supermarchés et les fromageries sont aussi proches que possible du sans gluten, ce qui signifie qu'ils contiennent tous un niveau de gluten indétectable. Les principaux ingrédients du fromage sont le lait, la présure (une enzyme caillant le lait) et les bactéries (qui fermentent le lait).
Lors de la pratique d'un régime sans gluten, il faut toujours se méfier de la contamination croisée par le gluten, ainsi que lorsque d'autres ingrédients sont ajoutés comme arômes dans les fromages. Une nouvelle tendance des fromages imbibés de bière et de spiritueux fait son apparition, comme le cheddar irlandais infusé de bière stout ou le whisky irlandais. Les deux ajoutent un niveau dangereux de gluten aux fromages qu'ils aromatisent. Dans ces cas, il est fortement recommandé aux personnes souffrant d'allergies au gluten d'éviter de consommer l'un de ces types de fromage.
De plus, les personnes souffrant d'allergies au gluten ou de maladie cœliaque se sont inquiétées de certains types de fromages bleus contenant du gluten, car la bactérie classiquement utilisée pour les fabriquer, Penicillium roqueforti, est traditionnellement cultivée sur du seigle, du malt ou du dextrose à base de blé, qui contiennent tous du gluten. Une étude réalisée en 2009 par l'Association canadienne de la maladie cœliaque a testé un groupe de fromages bleus pour le gluten et a révélé que les niveaux étaient tous inférieurs à une partie par million, ce qui est un niveau indétectable. Néanmoins, les personnes atteintes de la maladie cœliaque doivent toujours procéder avec prudence, alors demandez toujours à votre vendeur autant d'informations que possible sur les origines d'un produit que vous envisagez d'acheter.