Les bagels peuvent être conservés dans un garde-manger pendant un à deux jours. Il est préférable de les consommer dans les trois mois suivant leur conservation au congélateur.
Conservez les bagels à température ambiante dans un sac en plastique transparent et scellé avant de les mettre dans le garde-manger. Pour conserver les bagels au congélateur, placez-les dans un sac de congélation robuste, enveloppez-les dans du papier d'aluminium ou enveloppez-les dans une pellicule de congélation. Gardez le congélateur à 0 degrés Fahrenheit pour les garder frais le plus longtemps possible. Ne conservez pas les bagels au réfrigérateur pendant un certain temps, car ils pourraient se dessécher et devenir rassis.