Alors que le fromage nature est fabriqué à partir d'ingrédients entièrement naturels et affiné, le fromage fondu est généralement fabriqué en partie à partir de fromage naturel avec des conservateurs et des ingrédients artificiels ajoutés. Le fromage fondu est ensuite émulsionné et pressé en forme pour le tranchage ou extrudé dans des boîtes et des bocaux. Le fromage fondu a également généralement une teneur en sodium beaucoup plus élevée que le fromage naturel, et contrairement au fromage naturel, il est généralement stable à la conservation.
La plupart des fromages naturels sont fabriqués à partir d'ingrédients très simples : lait, présure (enzymes produites dans l'estomac des ruminants) et sel. Les saveurs et les textures naturelles du fromage proviennent principalement de différents types de lait et de présure. Une fois le lactosérum égoutté du caillé, il est transformé en meules et vieilli (de 60 jours à trois ans dans certains cas) pour obtenir le bon goût.
Bien que les fromages fondus contiennent du fromage naturel, ils contiennent également du lactosérum, de la culture de fromage et d'autres additifs tels que le citrate de sodium, le phosphate de sodium et l'acide sorbique. De plus, contrairement à de nombreux fromages naturels, une grande partie du fromage fondu contient du rocou pour le colorer en orange. La plupart des fromages fondus ont été conçus pour une longue durée de conservation, donc une fois émulsionnés et mélangés, ils peuvent être emballés et expédiés immédiatement. Bien qu'il soit plus pratique à certains égards que le fromage naturel, le fromage fondu est également généralement plus cher que les variétés courantes telles que le cheddar et le suisse.
