Les cuisiniers n'ont pas à retirer les branchies des champignons portobello. Ceux qui choisissent de retirer les branchies peuvent utiliser une cuillère pour les gratter.
Enlever les branchies des champignons portobello peut être bénéfique pour la présentation du plat en cours de préparation, car cela peut noircir d'autres ingrédients en raison des branchies qui donnent leur couleur à tout ce avec quoi on les cuisine. La décoloration de la couleur peut affecter les sauces, les farces ou les vinaigrettes que quelqu'un utilise dans sa recette. Certaines branchies cachent un peu de sable à l'endroit où les champignons ont poussé, donc les enlever peut empêcher le sable dans les aliments. Lorsque du sable reste dans les branchies, cela peut rendre la nourriture granuleuse car la cuisson des champignons ne l'élimine pas.