Une tarte aux pacanes fraîchement cuite et non coupée peut être conservée à température ambiante pendant deux heures avant d'être servie. Si la tarte aux pacanes est réfrigérée, elle se conserve jusqu'à quatre jours.
La tarte aux pacanes doit être réfrigérée après avoir été coupée ou si elle est destinée à être servie plus de deux heures après sa préparation. La teneur en humidité de la tarte, ainsi que la teneur en protéines de ses ingrédients, peuvent entraîner une multiplication rapide des bactéries si la tarte est laissée à température ambiante.
Une tarte aux pacanes peut être conservée au congélateur jusqu'à deux mois. La tarte doit être conservée dans un sac de congélation robuste ou emballée dans une pellicule de plastique pour congélation ou du papier d'aluminium avant d'être congelée.