Environ 100 espèces de plantes et d'herbes contiennent de la caféine. La caféine est moins présente dans les fruits, mais la noix de cola contient de la caféine, tout comme les graines du fruit du guarana et du cacaoyer .
Les plants de guarana produisent de petits fruits dont les graines contiennent une concentration de caféine plus élevée que les grains de café. Certaines espèces de coffea produisent des fruits rouges et violets comestibles appelés cerises. Ces cerises contiennent des graines qui contiennent de la caféine. Les plants de citron, de pamplemousse et d'orange contiennent de la caféine dans leurs feuilles et leurs fleurs, mais pas dans les fruits eux-mêmes.
La plupart des fruits issus de plantes à fleurs ne contiennent pas de caféine. La caféine naturellement présente dans les plantes et les graines agit souvent comme un mécanisme de défense pour décourager les herbivores de manger la plante.