La choucroute doit être conservée au réfrigérateur pour conserver sa saveur et décourager la croissance des bactéries. La réfrigération est particulièrement nécessaire si le récipient de choucroute a été ouvert.
Les recettes de choucroute varient, mais au cœur de chacune se trouve le chou fermenté. La choucroute conservée au réfrigérateur reste comestible jusqu'à plusieurs mois tant qu'elle est bien couverte. Il peut également être congelé ou mis en conserve pour le conserver plus longtemps. Une méthode de préparation de la choucroute en conserve consiste à faire bouillir la choucroute et la saumure avec laquelle la mariner, et une autre n'utilise que le saumurage et non la chaleur.