La troupe de gui de Muskogee, Oklahoma, est créditée de la fabrication du tout premier lot de biscuits Girl Scout en 1917, et les biscuits ont été cuits dans une cafétéria de lycée. Au début, les membres de la troupe et leurs familles s'occupaient des tâches de cuisson dans les cuisines familiales. En 1922, Florence E. Neil, chef de troupe des éclaireuses de Chicago, a partagé une recette de biscuits bon marché dans le magazine de l'organisation. La recette produisait des dizaines de biscuits que les troupes vendaient 25 à 30 cents la douzaine.
En 1936, les membres de la troupe n'avaient plus besoin de préparer des biscuits à domicile pour la vente, car l'organisation des éclaireuses a autorisé une boulangerie professionnelle à gérer toutes les opérations de fabrication de biscuits. Les années 1940 ont vu l'expansion des boulangeries commerciales impliquées dans la production de biscuits Girl Scout. Popular Thin Mints a fait ses débuts en 1939 sous le nom de Cooky-Mints, et au début des années 1950, le nom a changé pour Chocolate Mints. Les sablés Treefoils et Do-si-dos, un biscuit sandwich au beurre d'arachide complétaient les options de saveurs de l'organisation.
Dans les années 60, les boulangeries ont commencé à utiliser du papier d'aluminium pour emballer les biscuits Girl Scout, ce qui les garde plus frais. Le nombre de boulangeries commerciales impliquées dans la fabrication de biscuits Girl Scout est passé de 30 à seulement deux. Les deux boulangeries créent huit variétés de biscuits au goût et à l'apparence similaires. Les trois saveurs originales sont toujours produites pour les clients, parfois une nouvelle saveur est introduite comme Savannah Smiles, faite en l'honneur de la première réunion de la troupe Girl Scout.