Un bloc ou un morceau de fromage suisse peut durer un à deux mois au réfrigérateur avant de commencer à moisir, mais le fromage suisse tranché et coupé ne durera qu'un mois au réfrigérateur avant moulage. Le le fromage à pâte mi-dure se conserve de six à huit mois lorsqu'il est conservé au congélateur.
La conservation du fromage suisse à la bonne température est la clé pour prolonger sa durée de conservation. La température du réfrigérateur doit être de 40 degrés Fahrenheit et le fromage doit être emballé dans son emballage d'origine ou dans un contenant hermétique. Pour éviter que le fromage suisse ne se détériore, ne le gardez pas plus de deux heures d'affilée.