Il y a 23 ingrédients dans Dr Pepper, dont aucun n'est connu du public. La saveur inhabituelle a été inventée par un pharmacien qui a créé l'arôme de soda pour reproduire l'odeur de sirops de fruits assortis dans la pharmacie où il travaillait, selon le musée Dr Pepper.
Le seul indice donné par la société sur les ingrédients de Dr Pepper est que le produit ne contient pas de jus de pruneau. La légende raconte que le pharmacien Charles Alderton a inventé le premier Dr Pepper au Morrison's Old Corner Drug Store à Waco, Texas en 1885. Après de nombreux tests, Alderton a offert un avant-goût de la concoction sirupeuse à Wade Morrison, son employeur. Wade Morrison est crédité d'avoir donné son nom au soda noir.
Le Dr Pepper a été présenté au public américain lors de la Louisiana Purchase Exposition à St. Louis, Missouri en 1904. Le Dr Pepper a abandonné le terme de son nom dans les années 1950.