Selon About.com, le tapioca ne contient aucun gramme de matières grasses et de protéines, ce qui en fait un amidon naturel sain extrait de la racine de manioc. Le tapioca est également sans gluten, ce qui lui permet d'être un alternative saine pour ceux qui souffrent de la maladie cœliaque.
Le Huffington Post rapporte que le tapioca utilisé dans le thé boba peut contenir des biphényles polychlorés, un produit chimique lié au cancer et pouvant avoir des effets néfastes sur les systèmes nerveux, endocrinien, immunitaire et reproducteur. Le produit chimique n'a aucune utilité dans le tapioca naturel, est un matériau synthétique et est interdit aux États-Unis. Le tapioca contaminé était lié à des fabricants de Taïwan. Les principaux fabricants de tapioca ont depuis contesté la conclusion, déclarant les méthodes de test trompeuses.