Le National Human Genome Research Institute affirme que les fraises ont sept chromosomes uniques. Cependant, grâce à la reproduction humaine, les fraises sont capables d'avoir de nombreuses combinaisons chromosomiques différentes par variété.
Les variétés de fraises présentent toutes leur propre polyploïdie, ce qui signifie le nombre de fois que leurs chromosomes uniques sont dupliqués. Par exemple, les fraises diploïdes dupliquent deux fois leurs sept chromosomes pour un total de 14 chromosomes. Les fraises tétraploïdes dupliquent leurs chromosomes quatre fois pour 28 au total, tandis que les fraises hexaploïdes dupliquent six fois pour 42 chromosomes au total. Les fraises peuvent également être octoploïdes avec huit ensembles ou décaploïdes pour dix ensembles. Les fraises avec plus de duplication sont plus grosses et produisent plus de baies par plante.
