La plupart des produits de compote de pommes n'ont pas de conservateurs, par conséquent, ils finiront par se détériorer et devraient être jetés. La plupart des contenants de compote de pommes, qu'ils soient en portion individuelle ou en pot, auront un date, qui doit être notée avant de manger.
Les contenants de compote de pommes non ouverts peuvent rester bons à manger jusqu'à un an, tant qu'ils sont conservés dans un endroit frais et sec, comme dans un garde-manger à température ambiante. Une fois qu'un contenant de compote de pommes est ouvert, il doit être conservé au réfrigérateur. Une fois ouverte, la compote de pommes est encore bonne jusqu'à 10 jours. Comme pour tout, si on ne sait pas depuis combien de temps la compote de pommes a été réfrigérée ou si elle a une odeur ou un goût désagréable, elle doit être jetée immédiatement.