La durée pendant laquelle les pétoncles restent frais dépend d'un certain nombre de facteurs, par exemple si les pétoncles sont décortiqués ou encore dans la coquille ; par exemple, les pétoncles écaillés frais peuvent rester frais au réfrigérateur jusqu'à quatre jours. Les mollusques vivants comme les pétoncles peuvent être conservés dans un réfrigérateur à 34-38 degrés Fahrenheit jusqu'à 10 jours.
Les pétoncles décortiqués doivent être conservés dans un plateau plat qui leur permet de s'étaler. Tapisser le fond du plateau, ajouter les noix de Saint-Jacques puis garnir de glaçons. Conserver les pétoncles dans la glace jusqu'au moment de les utiliser. Les pétoncles frais peuvent également être conservés dans de l'eau congelée dans des sacs en plastique refermables jusqu'à six mois à 0 degré Fahrenheit.