Panera Bread modifie son menu du déjeuner en proposant des options de soupe quotidiennes, et la chaîne de restaurants propose également de nouvelles options de menu chaque printemps, été, automne et hiver. Chaque jour, Panera propose sept soupes dont deux selon un horaire rotatif.
Chaque dimanche, mardi, jeudi et samedi, les options de soupe alternatives sont la soupe végétarienne aux haricots noirs faible en gras et la soupe à la crème de poulet et au riz sauvage, à partir de 2015. Chaque lundi et mercredi, ce sont la soupe de pommes de terre au four et la soupe faible en gras. Soupe végétarienne grasse aux légumes du jardin avec pesto. Chaque vendredi, la soupe de légumes du jardin végétarienne faible en gras avec pesto et chaudrée de palourdes de la Nouvelle-Angleterre est ajoutée au menu.
Les menus de saison proposent des plats tels que la salade de fraises, graines de pavot et poulet au printemps et en été, les raviolis à la courge musquée en automne et le gruau Power Almond Quinoa en hiver.