Les coquilles d'edamame ne sont pas comestibles. L'edamame ou le soja à l'intérieur de la gousse est comestible.
Selon le National Soybean Research Laboratory, les coquilles d'edamame sont trop dures pour être mangées ou digérées facilement. Au lieu de cela, les convives devraient retirer les graines d'edamame de leurs coquilles avant de manger. Les convives peuvent utiliser leurs dents pour gratter les graines ou fendre les gousses pour utiliser les graines dans les salades ou comme accompagnement ; les convives doivent ensuite jeter les coquilles ou les ajouter au compost.
Les edamames sont souvent conservés dans leur coquille pour aider à maintenir la fraîcheur. Les cuisiniers ne devraient jamais servir les edamame crus, car les graines sont difficiles à retirer de leur coquille ; les cuisiniers doivent faire bouillir les gousses entières pendant environ 5 minutes ou les cuire à la vapeur au micro-ondes.