La fonction d'un micropyle diffère légèrement selon qu'il est utilisé en botanique ou en zoologie. En botanique, un micropyle fait référence à toute ouverture dans la couche externe d'un ovule. Cette ouverture permet au pollen de fertiliser la plante. En zoologie, c'est un pore dans la membrane d'un ovule.
Un micropyle dans la membrane de l'ovule permet à un spermatozoïde d'entrer dans l'ovule. Chez les plantes et les animaux, un micropyle sert d'ouverture qui permet à un agent fertilisant d'entrer et d'interagir avec l'œuf ou l'ovule. L'origine du mot peut être datée entre 1815 et 1825 et a ses racines dans la langue grecque.