Les bacilles présentent souvent une résistance aux environnements difficiles tels que la chaleur, les radiations, les désinfectants et le séchage en raison de leurs endospores. Selon MicrobiologyBytes, les spores de Bacillus ont une enveloppe extérieure résistante en kératine, ce qui les rend très résistantes à la chaleur et aux produits chimiques.
Selon le département de microbiologie de l'Université Cornell, les endospores de Bacillus donnent à l'organisme la capacité de prospérer et de croître dans des environnements difficiles tels que les déserts, les sources chaudes, les sols arctiques et les sédiments marins. Les endospores sont une forme dormante de la bactérie et seuls quelques genres de bactéries, tels que Bacillus et Clostridium, sont capables de former des endospores. Bacillus se trouve dans le sol, tandis que Clostridium se trouve dans le tractus gastro-intestinal des animaux.
Les endospores se forment dans des conditions de famine. Cornell explique qu'une seule endospore se forme au sein d'une bactérie par un processus appelé sporulation, qui nécessite beaucoup de temps et d'énergie de la part de la bactérie. Une fois formées, plusieurs couches de couches résistantes, telles qu'un cortex, une couche de spores et parfois un exosporium, recouvrent l'endospore terminée. Jusqu'à ce qu'une variété de déclencheurs environnementaux encouragent la germination, l'endospore survit et attend son heure. Une fois encouragée à se développer, une excroissance d'une seule bactérie est produite à partir de la germination. Les endospores de Bacillus sont une adaptation très efficace pour la survie.