Les types de protistes, qui sont des eucaryotes, qui ne sont pas des animaux, des champignons ou des plantes comprennent les euglenoza, les alévolés, les straménopiles, les algues rouges, les moisissures visqueuses et les choanoflagellés. Le groupe des alévolés comprend les ciliés, les sporozoaires et les dinoflagellés. Le groupe straménopile comprend les diatomées, les algues dorées, les algues vertes et les moisissures aquatiques.
Euglenoza, des protistes unicellulaires qui nagent au moyen d'un seul flagelle, comprend Euglena ainsi que Trypanosoma brucei. Les protistes ciliés, qui se déplacent en battant leurs cils, comprennent Paramecium, Stentor, Vorticella et Tetrahymena thermophila. Les sporozoaires comprennent le genre Plasmodium, la bactérie qui cause le paludisme, une maladie potentiellement mortelle. Les dinoflagellés comprennent environ 1 000 espèces de protistes et sont responsables de la formation de marées rouges vénéneuses dans les environnements marins. Les diatomées sont des producteurs majeurs dans les milieux aquatiques et une base principale pour les chaînes alimentaires aquatiques. Les algues dorées comprennent plus de 1 000 espèces de protistes unicellulaires que l'on trouve principalement en eau douce. Les algues brunes comprennent les fucus et les varechs que l'on trouve principalement dans les environnements d'eau salée. Certaines moisissures aquatiques, telles que Saprolegnia, sont des parasites des poissons qui causent des problèmes aux écloseries. Les algues rouges comprennent environ 6 000 espèces de protistes qui sont presque exclusivement marines. Les moisissures visqueuses peuvent être cellulaires ou acellulaires. Les choanoflagellés sont des protistes aquatiques unicellulaires qui ont un seul flagelle entouré d'un collier de microvillosités.
