Les quatre étapes de la bêta-oxydation sont la déshydrogénation, l'hydratation, une seconde déshydrogénation et le clivage thiolytique, note la bibliothèque des sciences de la santé de l'Université de l'Utah. Une enzyme distincte catalyse chaque étape.
La première étape est la déshydrogénation, et cette étape a lieu entre les carbones alpha et bêta dans une réaction liée au FAD, comme expliqué sur Study.com. L'étape suivante est l'hydratation car l'enzyme Enoyl-CoA redonne un hydrogène au carbone alpha et ajoute un oxygène au carbone bêta. Ensuite, une deuxième déshydrogénation a lieu dans une réaction liée au NAD. Au cours de la phase finale, une réaction catalysée par une thiolase se produit qui clive le bêta-cétoacyl-CoA.