Manquant d'appendices, les serpents ont un corps simple composé d'une tête, d'un corps et d'une queue. De plus, certains serpents présentent un rétrécissement juste derrière la tête, ce qui leur donne également un cou perceptible. Certaines lignées primitives de serpents, comme les boas et les pythons, ont conservé leur ceinture pelvienne. L'inspection de la queue de ces serpents révèle de minuscules griffes ou éperons, qui sont les restes des pattes arrière une fois attachées à leur bassin.
Les serpents ont plusieurs parties du corps uniques. L'ouverture du tractus intestinal d'un serpent s'appelle l'évent. L'évent est identifié en notant une grande échelle semi-circulaire près de l'extrémité postérieure du serpent. La queue d'un serpent commence à l'évent et s'étend jusqu'au bout de son corps. Différentes espèces ont développé différents types de queues. Les espèces arboricoles, telles que les pythons verts, ont des queues exceptionnellement longues qui les aident à saisir les branches. En revanche, les espèces terrestres, comme les couleuvres royales, ont des queues relativement courtes. Les crotales ont des queues évoluées qui produisent un bruit lorsqu'elles sont secouées.
Les serpents n'ont pas d'ouverture d'oreille externe, bien qu'ils aient quelques structures d'oreille interne. Les serpents n'ont pas de paupières ; au lieu de cela, ils ont des écailles claires, appelées lunettes, pour couvrir leurs yeux. Cela protège leurs yeux et les empêche de se dessécher. De nombreux boas et pythons ont des fossettes dans les écailles de leurs lèvres, ce qui leur permet de détecter la chaleur de leur environnement.
