Les maladies qui ont frappé les premiers colons américains comprenaient le typhus, également connu sous le nom de fièvre typhoïde ou fièvre pourprée, ainsi que le paludisme et l'encéphalite. La dysenterie et l'hypernatrémie, également connues sous le nom d'empoisonnement au sel, représentaient également une menace notable pour le santé des colons américains.
La variole était également une menace sinistre à l'époque. Une épidémie de variole dans le Williamsburg colonial de 1747 à 1758 a touché 754 personnes. De grandes populations d'Amérindiens ont été décimées pendant la période coloniale lorsqu'elles ont contracté des maladies, notamment la variole. Les épidémies de maladies d'origine européenne ont réduit la population d'Amérindiens en Nouvelle-Angleterre de 90 % entre 1615 et 1633.
