La différence entre la synthèse par déshydratation et l'hydrolyse est que dans l'une, des liaisons se forment, tandis que dans l'autre des liaisons sont détruites. La synthèse par déshydratation lie les molécules entre elles en éliminant l'eau. Dans l'hydrolyse, de l'eau est ajoutée aux molécules afin de dissoudre ces liaisons.
La synthèse par déshydratation et l'hydrolyse effectuent deux tâches différentes lorsqu'il s'agit de macromolécules ou de polymères. Les polymères sont des molécules liées entre elles de manière covalente. Selon le site Web About, lorsque l'eau est soustraite de l'équation chimique, de petites molécules ou monomères se lient pour former des polymères. Afin de décomposer ces composés, de l'eau doit être ajoutée à l'équation. Par exemple, les glucides sont un exemple de polymère. Les glucides sont constitués de monomères de sucre liés entre eux lorsque l'eau en est lessivée. Pour que les gens digèrent les glucides, ils doivent être décomposés, ce qui se produit lorsque la deuxième eau est réintroduite dans les monomères de sucre.
Selon la Peace Org, l'hydrolyse n'est que l'opération inverse de la synthèse par déshydratation. Plus il y a d'eau lessivée de ces molécules de sucre, plus la chaîne glucidique s'allonge, formant des polysaccharides. Ce même processus est nécessaire à la formation et à la décomposition des protéines et des acides nucléiques. Les seules macromolécules organiques sur lesquelles il n'agit pas sont les lipides.