Mercure a un gros noyau métallique avec une croûte rocheuse relativement mince et un manteau qui a une grande abondance de soufre et de potassium. Son champ magnétique est décentré, ce qui indique que sa structure interne est complexe et inhabituel. Après la Terre, c'est la deuxième planète la plus dense du système solaire.
Le mercure n'a pas d'atmosphère, mais il est entouré de gaz dans ce qu'on appelle son exosphère. Ceci est produit par le vent solaire qui enlève les atomes de la surface de Mercure et les envoie dans l'espace, où ils entrent en collision avec de minuscules météorites. Cela fait que Mercure a une queue semblable à une comète.