Les facteurs biotiques sont des organismes vivants affectant un écosystème particulier et leurs relations. Les poissons, les grenouilles, les plantes aquatiques, les bactéries et les insectes sont des facteurs biotiques dans un habitat fluvial.
Les mesures indirectes des facteurs biotiques fournissent des informations précieuses sur un environnement et ses habitants. Une concentration élevée de chlorophylle a dans un estuaire est un indicateur de prolifération d'algues; une augmentation dangereuse du nombre d'algues pouvant entraîner la mort des habitants de l'estuaire. Une baisse de la biodiversité signale la détérioration de la santé d'un écosystème.
Les facteurs abiotiques sont des impacts non vivants sur un écosystème et comprennent les conditions météorologiques, les formes de relief, la salinité de l'eau et les événements géologiques. Les mesures de la densité du sol, de la disponibilité de l'eau et des heures d'ensoleillement indiquent la probabilité de survie des plantes et la survie des animaux qui dépendent de cette plante comme source de nourriture. Des conditions météorologiques plus sèches modifient la composition d'un habitat vers des espèces résistantes à la sécheresse.
Les études sur les facteurs biotiques et abiotiques ont des impacts commerciaux. Le termite souterrain de Formosa cause jusqu'à 2 milliards de dollars de dégâts par an aux États-Unis. L'identification de la valeur d'un relief particulier pour les termites permet des mesures de prévention ciblées à son emplacement. La contamination par le méthylmercure d'une centrale au charbon s'accumule dans les tissus des poissons et non seulement cause des dommages à l'industrie de la pêche sportive, mais nécessite de nouveaux protocoles pour les avertissements de consommation d'aliments dangereux.
