Le clonage crée une controverse pour plusieurs raisons, généralement classées comme préoccupation pour la sécurité humaine et préoccupation concernant le traitement inapproprié ou contraire à l'éthique des animaux. Le clonage attire la résistance de certains pour modifier les processus biologiques afin d'améliorer ou de créer certaines caractéristiques, telles qu'une couleur plus vive, une plus grande taille ou une fourrure plus douce. Certains soutiennent que ces changements sont en conflit avec les normes biologiques et présentent des risques de maladie et de maladie pour les humains et les autres animaux exposés aux organismes génétiquement modifiés.
Le clonage suscite des critiques dans le contexte de la réplication animale et végétale, et invite encore plus de critiques lorsqu'il est appliqué aux humains. Alors que certains chercheurs et scientifiques louent le clonage pour éradiquer certaines maladies et faciliter la vaccination, d'autres citent la résistance aux maladies et le développement de nouvelles allergies comme contrepoints. Certains chercheurs, par exemple, pensent que boire du lait d'animaux clonés, enrichi de nutriments et d'antibiotiques, pourrait contrôler la propagation des maladies dans les zones pauvres, s'avérant plus efficace et moins cher que les vaccinations traditionnelles.
D'autres, comme les défenseurs du bien-être animal, mettent en garde ces mesures comme étant expérimentales et non fondées sur des années d'études scientifiques, ce qui soulève des questions de sécurité. Le clonage fait l'objet de critiques parmi certains biologistes, craignant que la sélection et le remplacement artificiels de gènes ne modifient en fin de compte certaines espèces, les mettant en danger de mutations, de défauts et même d'extinction, car la variation génétique diminue avec le temps.
