Les paires homologues de chromosomes portent les mêmes gènes. Bien que les chromosomes portent les mêmes gènes, chaque chromosome d'une paire homologue pourrait porter une forme différente du gène, appelée allèle. Un chromosome de chaque paire homologue est prélevé sur chaque parent.
Les organismes contenant des paires de chromosomes qui ont les mêmes gènes sont appelés organismes diploïdes. Les humains ont une paire de chromosomes portant les mêmes gènes car il s'agit d'une mesure de sécurité contre les erreurs et les mutations. Pour illustrer, si un organisme n'avait qu'un seul chromosome et que le chromosome contenait le gène codant pour une protéine défectueuse, l'organisme peut ne pas être capable de fonctionner normalement et peut mourir. D'un autre côté, si un organisme avait deux chromosomes contenant deux des mêmes gènes, même si l'un était défectueux, le gène de l'autre chromosome peut coder pour la forme normale de la protéine, et l'organisme peut survivre sur la base du gène normal. seulement.