La congélation d'aliments ou d'autres articles ne tue pas toutes les bactéries ou autres micro-organismes présents. Les températures de congélation peuvent tuer certaines bactéries, et le froid empêche les bactéries de se développer et de se multiplier tant que la température reste en dessous de zéro ; Cependant, ramener les aliments à température ambiante permet aux bactéries de se réveiller et de recommencer à se multiplier.
La cuisson des aliments est une méthode pour éliminer les bactéries. Différents niveaux de chaleur tuent différents micro-organismes, c'est pourquoi le poulet, le porc et le bœuf doivent être cuits à des températures spécifiques pour rendre les aliments salubres. La cuisson ne détruit pas les toxines laissées par la croissance bactérienne, donc le simple fait de cuire des aliments qui ont été laissés à température ambiante trop longtemps ne les rend pas sains à manger.
Une autre méthode pour tuer les bactéries sur les aliments est l'élimination de l'eau nécessaire à la survie des bactéries. Le salage des aliments peut extraire l'humidité, les rendant inhospitaliers aux bactéries. La déshydratation et la lyophilisation sont d'autres méthodes pour éliminer l'humidité et conserver les aliments.
Les bactéries n'aiment pas non plus les environnements acides. Le décapage des aliments consiste à les conserver dans un bain acide, et si l'acidité appropriée est maintenue, cela empêche les bactéries de pénétrer dans les aliments ou de se développer tant que l'environnement reste contrôlé.