L'autopollinisation, également appelée pollinisation libre, maintient les attributs uniques de l'espèce représentative mais n'offre pas de protection contre l'extinction des espèces et peut même causer des dommages à une espèce en reproduisant des maladies et des virus qui sont transmis aux générations successives . L'autopollinisation garantit la pureté de la race et de l'espèce en veillant à ce que les graines naturelles soient disséminées et repeuplées.
Les avantages et les inconvénients de la pollinisation libre sont souvent opposés aux effets de la pollinisation croisée ou de la pollinisation hybride, et chaque forme de dissémination des graines a ses avantages et ses faiblesses. Les plantes qui se reproduisent par autopollinisation sont nettement moins chères pour les jardiniers et les agriculteurs à élever et à cultiver année après année. Leurs graines sont portées par les vents, les oiseaux et les abeilles et repoussent d'année en année sans nécessiter d'achats annuels. Les plantes autogames ont également des modèles de croissance et des besoins en habitat prévisibles. Certaines sont annuelles et d'autres vivaces, et les producteurs savent que chaque espèce a des besoins particuliers en matière d'arrosage, d'ensoleillement et de sol. Cependant, les plantes autogames n'ont pas une couleur et d'autres caractéristiques uniformes, ce qui pourrait les rendre moins attrayantes pour les consommateurs. Ils sont également sujets aux impacts négatifs des maladies et autres dangers environnementaux, car un lot de graines infectées ou de mauvaise qualité peut affaiblir une espèce et peut éventuellement entraîner sa mort.
