Les graines, par rapport aux spores, ont des avantages distincts en raison de leurs coquilles externes dures et de leurs structures internes appelées endospermes, qui fournissent des nutriments essentiels aux semis clos. Les graines ne se trouvent que dans les plantes à fleurs et les gymnospermes. Ils contiennent des embryons au plus profond de leur centre, qui sont entourés d'un sac de nutriments et de minéraux entouré d'une coque extérieure protectrice résistante qui protège la graine en croissance de la prédation et de l'exposition potentiellement mortelle aux éléments.
Les coques extérieures dures des graines sont peut-être leurs atouts les plus précieux. Les téguments aident à protéger les semis en croissance contre les dommages causés par l'équipement et les machines agricoles, la dessiccation et la prédation par les punaises, les insectes et les oiseaux. Les coques protègent également contre les conditions potentiellement dangereuses telles que le vent, les fortes pluies, le gel et la chaleur extrême. Ces coquilles externes dures sont également très utiles pour protéger les espèces situées dans les zones sujettes aux incendies : contrairement aux spores, qui flétrissent et meurent à des températures élevées, les graines protègent leurs embryons internes de la destruction pendant les incendies, leur permettant de rester en dormance et de continuer à croître en toute sécurité. Les endospermes dans les graines sont également des contributeurs importants à la croissance et au succès de l'embryon enfermé. Les endospermes, tout comme les utérus humains, fournissent aux plantules les nutriments et les minéraux dont ils ont besoin pour grandir et se développer pleinement.