La déforestation, la conversion des terres et le changement climatique représentent les trois plus grands risques pour les forêts tropicales. Les forêts tropicales, comme d'autres écosystèmes, nécessitent des conditions spécifiques pour une santé optimale. Ils sont confrontés à la destruction et aux dommages permanents causés par de nombreuses activités humaines, principalement motivées par des incitations économiques, telles que l'exploitation forestière et l'agriculture commerciale.
Parmi les menaces de la forêt tropicale, la déforestation pose de nombreux problèmes. La déforestation consiste à abattre des arbres et à défricher de vastes étendues de terres de forêt tropicale pour l'usage humain. Certaines personnes récoltent des arbres dans la forêt tropicale, les utilisent pour la construction et créent des biens de consommation à base de bois. L'exploitation forestière se produit légalement et illégalement ; alors que l'exploitation forestière durable ne constitue pas une menace majeure pour les forêts tropicales, l'exploitation forestière illégale fait des ravages. Selon le World Wildlife Fund, les forêts tropicales de Bornéo font face à une perte de terres de plus de 55 pour cent. La demande mondiale croissante d'huile de palme, une substance présente dans de nombreux produits alimentaires, alimente le taux de déforestation. La perte de terres laisse de nombreuses espèces indigènes sans abri et sans ressources de base, mettant finalement en péril leur survie. Le besoin de terres de ranch et de pâturage du bétail contribue également à la déforestation.
La conversion des terres, telle que la transformation des terres forestières en champs pour les plants de soja et de palmier à huile, augmente le risque d'inondations et d'incendies dans les zones environnantes. Déraciner et abattre les arbres enlève les capacités d'absorption d'eau des forêts, et l'invasion humaine dans les forêts conduit à des terres plus sèches qui sont sujettes aux incendies. Enfin, le changement climatique, notamment de plus grandes quantités de dioxyde de carbone dans l'atmosphère et l'élévation du niveau de la mer, met en péril la santé de la forêt tropicale.