La graine d'une plante est également l'embryon de la plante, ce qui se produit lorsqu'un grain de pollen atteint un ovule et le féconde. L'embryon végétal fécondé contient la graine et les tissus nutritifs nécessaires pour nourrir l'embryon pendant qu'il commence à se développer en une plante.
Les nutriments à l'intérieur de la graine sont également appelés endosperme, qui sont généralement constitués de protéines, de graisses ou de glucides. Les ovules sont situés avec l'ovaire d'une plante à fleurs mature. L'ovaire est une grande structure ronde située à la base même de la fleur. Chez les conifères et autres plantes non florifères, les ovules sont situés à l'intérieur des écailles d'un cône de graine, souvent appelé pomme de pin. Dans les pommes, l'ovaire de la plante est le fruit qui pousse après la fécondation des ovules, et tout ce qui reste de la fleur sont les feuilles qui sont encore attachées au fruit.
Certaines graines restent en dormance jusqu'à ce que les conditions soient propices à la croissance. Cela empêche la plante de pousser trop tôt et de ne pas pouvoir survivre aux éléments. Les horticulteurs utilisent une technique appelée stratification pour soumettre les graines à des conditions humides et froides.
