La fonction principale de l'intestin grêle est d'absorber les aliments et les nutriments. Lorsque les aliments pénètrent dans l'estomac, l'acide commence à les décomposer et certains nutriments sont absorbés dans l'estomac. Ensuite, la nourriture passe dans l'intestin grêle, où les enzymes et le bicarbonate de sodium affluent du pancréas pour neutraliser tout acide gastrique restant et décomposer les nutriments restants. Le gros intestin absorbe l'eau et crée des matières fécales.
L'intestin grêle joue également un rôle dans le système immunitaire de l'organisme. La flore intestinale probiotique aide non seulement à la digestion des composés gênants, mais augmente également la réponse immunitaire du corps.
Lorsque la nourriture pénètre dans l'intestin grêle, le corps gère chaque type de molécule différemment. Les lipides se décomposent en acides gras et en glycérol, tandis que les protéines se décomposent en acides aminés et en peptides pour une absorption facile dans le corps. Les glucides peuvent se décomposer en sucres simples, mais les molécules de glucides complexes peuvent traverser l'intestin grêle de manière relativement intacte. Une fois qu'elles atteignent le gros intestin, les bactéries les décomposent et produisent des gaz intestinaux comme sous-produit. C'est pourquoi les aliments riches en glucides complexes, comme les haricots, peuvent provoquer des malaises intestinaux. Pour lutter contre cet effet, des enzymes spéciales décomposent les glucides complexes avant que les bactéries n'aient la possibilité de les consommer, empêchant ainsi la libération de gaz.