La nourriture pénètre dans le système digestif humain par la bouche avant de traverser le pharynx, l'œsophage, l'estomac, les intestins, le rectum et l'anus. Dans la bouche, la nourriture est mâchée et décomposée en petits morceaux appropriés pour digérer. La bouche produit plus de salive pour décomposer les aliments en une forme que le corps peut utiliser et absorber. Ensuite, la nourriture glisse le long du pharynx, également appelé gorge. La nourriture est ensuite avalée dans le pharynx par réflexe.
Les aliments passent par l'œsophage, qui s'étend du pharynx et derrière la trachée, pour se diriger vers l'estomac. La nourriture est poussée à travers ce tube musculaire et dans l'estomac par une série de contractions musculaires involontaires appelées péristaltismes. Près de l'ouverture de l'estomac, le sphincter inférieur de l'œsophage s'ouvre pour permettre aux aliments de passer dans l'estomac et se ferme pour empêcher les aliments de retourner dans l'œsophage. Les glandes gastriques sécrètent des enzymes et de l'acide qui transforment les aliments en une substance liquéfiée appelée chyme. Les glandes sécrètent également du mucus, qui protège l'estomac des ulcères. Après un certain temps, la nourriture est réduite en chyme ou parfois en une substance pâteuse et solide. Cette substance pénètre dans l'intestin grêle et le gros intestin. L'intestin grêle décompose davantage les aliments en produisant des enzymes digestives. Le gros intestin élimine l'eau et les électrolytes des aliments. Enfin, les déchets sont stockés dans le rectum et excrétés par l'anus.