Selon des chercheurs de la Bibliothèque du Congrès, la gestion réussie de la rébellion du whisky a renforcé plusieurs idées constitutionnelles contestées par la rébellion, telles que le droit du gouvernement fédéral d'adopter et d'appliquer des lois, et le droit de percevoir des impôts auprès des citoyens de tous États. L'usage de la force a mis fin à la rébellion du whisky en 1794.
En 1791, le gouvernement fédéral était endetté, ayant assumé toutes les dettes de la guerre révolutionnaire pour les États. Pour aider à payer cette dette, le Congrès a approuvé une taxe d'accise sur les spiritueux distillés. La taxe a été évaluée en fonction de la capacité de l'alambic. Il variait de six à 18 cents le gallon et devait être payé en espèces. Il s'agissait de la première taxe sur les recettes intérieures à l'échelle nationale, selon le Bureau américain de la taxe sur l'alcool et le tabac et du commerce.
À l'ouest des Appalaches et des Allegheny, le whisky était souvent utilisé comme monnaie d'échange. De nombreux agriculteurs ont converti leurs récoltes en whisky, car il était plus facile à transporter que le grain et avait également une meilleure valeur marchande. En partie à cause des troubles de longue date au sujet des attaques indiennes, les agriculteurs se sont opposés à la taxe. Beaucoup refusaient tout simplement de le payer, et les percepteurs étaient souvent harcelés ; certains étaient même goudronnés et emplumés.
La violence s'est intensifiée jusqu'à ce que le président Washington marche avec des milices rassemblées dans les États pour réprimer la rébellion. À la mi-novembre 1794, 150 rebelles avaient été arrêtés. La plupart ont été libérés sans preuves, quelques-uns ont été jugés et seulement deux ont été reconnus coupables de trahison, tous deux graciés par la suite par le président Washington. Une partie de la milice est restée jusqu'au printemps suivant, date à laquelle la rébellion avait été réprimée avec succès.
