Comme indiqué sur le site de référence du NIH Genetics Home, lorsque les molécules d'ADN sont représentées sous forme d'échelles, les barreaux représentent les paires de bases de l'ADN. Les bases de l'ADN sont souvent représentées par G, A, T et C, qui représentent la guanine, l'adénine, la thymine et la cytosine. Lorsque deux brins d'ADN forment une hélice double brin, les bases s'apparient au milieu de la molécule.
Les bases de l'ADN n'ont pas toutes la même taille. Cela affecte la façon dont ils peuvent s'apparier au milieu d'une molécule. Les deux plus grandes bases sont la guanine et l'adénine, appelées purines. Les deux plus petites bases, appelées pyrimidines, sont la thymine et la cytosine. Le squelette sucre phosphate des molécules d'ADN est maintenu à la même distance sur toute la longueur de la double hélice. En conséquence, les purines doivent s'apparier avec les pyrimidines. Si deux pyrimidines appariées, la paire de bases ne serait pas assez large pour remplir le centre de la double hélice. Si deux purines appariées, la paire de bases serait trop large pour la molécule d'ADN. Les paires purine-pyrimidine sont spécifiquement A à T et G à C car les différentes bases sont capables de former deux ou trois liaisons hydrogène. Les paires de bases A à T et G à C ont tendance à se produire parce que ces appariements sont formés par une purine et une pyrimidine, qui sont toutes deux capables de former le même nombre de liaisons hydrogène.
