L'appariement de bases est la liaison spécifique de bases nucléotidiques complémentaires entre elles dans un acide nucléique. Dans l'appariement de bases, une purine se lie à une pyrimidine ; plus précisément, la guanine forme une liaison avec la cytosine et l'adénine se lie avec la thymine ou l'uracile, selon le type d'acide nucléique impliqué.
L'appariement des bases est si spécifique que si un brin d'ADN est connu, l'autre brin peut être reconstruit. Ce processus constitue la base de la réplication de l'ADN et de la transcription de l'ARN messager.
L'exactitude de l'appariement des bases vient de la taille des bases. Deux purines ne peuvent pas tenir sur un échelon et deux pyrimidines ne sont pas assez longues pour couvrir un échelon d'une molécule d'acide nucléique. Ce concept est appelé la règle d'appariement des bases de l'ADN de Chargaff. Cette règle explique également pourquoi les quantités d'adénine et de thymine sont équivalentes et les quantités de cytosine et de guanine sont égales dans une molécule d'ADN.
