La séquence Shine-Dalgarno est un arrangement spécifique et riche en purines de nucléotides dans l'ARNm procaryote qui cible l'ARN vers une petite sous-unité ribosomique pour la traduction. Cette séquence est nécessaire pour que la liaison ribosomique et la synthèse des protéines se produisent dans les cellules procaryotes. Il est également connu sous le nom de site de liaison du ribosome.
La séquence Shine-Dalgarno est située en amont de l'endroit où la traduction de l'ARNm en protéines a lieu, dans la région 5' non traduite, ou 5' UTR. Il existe plusieurs arrangements de nucléotides qui peuvent cibler l'ARNm procaryote vers les ribosomes pour que la traduction se produise, et plusieurs séquences Shine-Dalgarno ont été décrites par les scientifiques. Typiquement, la séquence est vue environ huit à 10 codons en amont du codon d'initiation AUG qui signale le début de la traduction de l'ARNm procaryote. Bien qu'il existe plusieurs séquences Shine-Dalgarno, elles partagent toutes une séquence consensus de six nucléotides dans un ordre spécifique : AGGAGG.
L'introduction de mutations dans la séquence Shine-Dalgarno peut avoir des effets différents selon le type de mutation et sa localisation. Une mutation de la séquence peut augmenter le taux de traduction, diminuer le taux ou n'avoir aucun impact.
La séquence Shine-Dalgarno a été décrite pour la première fois par les scientifiques australiens John Shine et Lynn Dalgarno. La séquence a également été observée chez les archées.
