Étant donné que la pluie peut être exposée à des contaminants dans l'air ou dans la méthode de collecte, elle peut être trop « sale » pour être bue. L'eau de pluie n'est généralement pas adaptée à une utilisation comme eau potable sans analyse et traitement éventuel.
La pollution, telle que la suie, la fumée et la poussière, peut être incorporée dans l'eau de pluie lorsqu'elle tombe dans l'atmosphère. Dans les zones agricoles, les résidus d'engrais en suspension dans l'air peuvent contribuer à une concentration plus élevée de nitrates dans l'eau de pluie. La méthode de collecte de l'eau de pluie peut laver les moisissures, les algues, les bactéries et autres matières organiques dans des conteneurs de stockage. Il peut être difficile de récolter une quantité importante d'eau de pluie en toute sécurité sans risquer qu'au moins quelques fientes d'oiseaux s'enroulent dans le baril de pluie.
Il est cependant possible de récolter l'eau de pluie pour une utilisation potable et la première étape consiste à tester l'eau pour s'assurer qu'elle peut être facilement traitée. Des systèmes de récupération des eaux de pluie sont disponibles et fournissent des directives et des équipements pour la collecte, la filtration et le traitement en toute sécurité de l'eau de pluie pour la consommation.
