La principale différence entre la prophase I et la prophase II est le processus de recombinaison génétique qui se produit pendant la prophase I, mais ne se répète pas dans la prophase II. Pendant la prophase I, les paires homologues dupliquées s'alignent et se croisent sur, qui est le processus par lequel les chromatides échangent des informations génétiques. Parce que ce processus se produit pendant la prophase I, il n'a pas besoin de se répéter pendant la prophase II.
Les prophases I et II sont les premières étapes du processus de méiose en deux phases, qui est la division cellulaire responsable de la production des cellules sexuelles ou des gamètes qui créent la variation génétique. Les gamètes résultants possèdent chacun la moitié du matériel génétique de la cellule mère d'origine. Selon Prentice Hall, pendant la prophase I, deux chromatides non sœurs s'alignent pour former une tétrade et échanger des informations génétiques. Étant donné que chaque chromatide non-soeur provient d'une cellule paternelle et d'une cellule maternelle, une variation génétique est créée lorsque chaque cellule se croise ou échange des informations avec l'autre. En raison de la durée de ce processus, la prophase I consomme 90 % du temps d'un processus de méiose en deux parties ; par conséquent, la prophase I est considérablement plus longue que la prophase II.
Au cours de la prophase II, qui se produit au cours de la deuxième phase de la méiose connue sous le nom de méiose II, l'enveloppe nucléaire se décompose et l'appareil à fuseau se forme. Ensuite, les chromosomes commencent à migrer vers le centre de la cellule. Ces processus se produisent également pendant la prophase I.
