Les insectes excrètent les déchets par l'anus, tout comme la plupart des autres animaux. Les insectes ont un système digestif complet, ce qui signifie que la nourriture se déplace dans une direction à travers un tube continu, appelé tube digestif. Cela contraste avec les animaux qui ont un système digestif à double sens, comme les étoiles de mer, les anémones et les méduses. Des systèmes digestifs complets permettent une spécialisation des structures, amenant les scientifiques à les considérer comme plus avancées que les systèmes à double sens.
Les insectes mangent de la nourriture par la bouche, dont la structure varie selon le type de nourriture qu'ils mangent. La nourriture passe ensuite par l'intestin antérieur, où les glandes salivaires aident à lubrifier l'article. Il est ensuite digéré lorsqu'il passe caudalement dans l'intestin moyen puis dans l'intestin postérieur. Le rectum sort par l'arrière de l'abdomen par une structure appelée anus.
Les insectes sont efficaces avec l'eau. Lorsque les aliments digérés passent dans le rectum, jusqu'à 90 % de l'eau est réabsorbée pour éviter la déshydratation. Plutôt que de produire de l'urine, les insectes utilisent un système de structures appelées tubules de Malpighi pour éliminer les déchets azotés du corps de l'insecte. Les tubules de Malpighi déposent les déchets dans le tube digestif, à la jonction de l'intestin moyen et de l'intestin postérieur. Les déchets sont ensuite éliminés avec les matières fécales.