L'un des principaux effets de l'égreneuse de coton sur l'esclavage a été le besoin accru d'esclaves pour maintenir la rentabilité liée à son invention. Avant l'invention de l'égreneuse, le coton n'était pas considéré comme un récolte lucrative.
Parce que retirer les graines du coton une fois récolté était une tâche fastidieuse, il était difficile de produire du coton rapidement et la récolte rapportait rarement de l'argent.
Avec l'invention d'Eli Whitney, la fibre de coton pourrait être produite rapidement et efficacement jusqu'à 50 livres par jour. Les propriétaires de plantations ont constaté qu'ils avaient besoin de plus d'esclaves sur le terrain pour répondre à la capacité accrue du gin. Alors que la tâche d'exploiter le gin était beaucoup moins pénible, la demande accrue d'esclaves a entraîné une augmentation de l'esclavage d'environ 700 000 esclaves dans les années précédant son invention à près du double au cours des deux décennies suivantes. Tout espoir que les abolitionnistes avaient pour une réduction ou une cessation de l'esclavage a pris fin avec cette machine.
D'autres aspects négatifs comprenaient l'élevage d'esclaves pour répondre aux demandes du marché aux esclaves revitalisé. Les familles étaient souvent séparées car les enfants naissaient spécifiquement pour être un produit commercialisable et finissaient par être vendus à d'autres plantations pour répondre aux besoins accrus. La taille croissante des plantations a également souvent entraîné des conditions de travail et de vie encore plus mauvaises.