Les atomes de zinc ont tous 30 protons dans leur noyau. Le nombre de protons d'un élément est égal à son numéro atomique, qui est répertorié dans le coin supérieur gauche de la boîte de l'élément sur le périodique tableau des éléments.
Les atomes portent toujours le même nombre d'électrons que de protons. Par définition, un atome doit avoir une charge globale neutre, et la charge négative de chaque électron annule la charge positive d'un seul proton. Le zinc possède donc 30 électrons ainsi que 30 protons. Le nombre de neutrons dans un atome peut varier et certaines configurations sont plus stables que d'autres. Les atomes d'un même élément avec différents nombres de neutrons sont appelés isotopes de cet élément.