Quelques-uns des micro-organismes les plus nocifs pour l'humanité sont Staphylococcus aureus, Escheria coli, Enterococcus faecium et Pseudomonas aeruginosa. Les micro-organismes qui causent des maladies sont appelés agents pathogènes.
Toutes les bactéries, la plupart des protozoaires et certains champignons sont des micro-organismes. Le terme "micro-organismes" est utilisé pour indiquer une forme de vie qui n'est pas visible à l'œil humain sans l'aide d'un microscope. Ceux-ci peuvent être une seule cellule ou constitués de plusieurs cellules. Il existe des micro-organismes dans tous les types d'environnement sur Terre, mais il y a plus de micro-organismes bénéfiques que de nuisibles. Le génie génétique implique la manipulation de micro-organismes pour créer des caractéristiques spécifiques dans des organismes plus grands.