Les théories sur ce qui est arrivé à la colonie de Roanoke vont de colons morts de maladie à être tués par des tribus amérindiennes locales. Une autre théorie dominante est que les colons ont abandonné Roanoke.
Ce que l'on sait de la colonie de Roanoke, c'est que la colonie était composée de 17 femmes, 11 enfants et 90 hommes. La présence de femmes et d'enfants implique que l'intention de ce groupe d'aller dans le Nouveau Monde était de s'y installer et de commencer une nouvelle vie, loin de l'Angleterre.
Lorsque la colonie de Roanoke a été découverte, il n'y avait aucune trace des colons qui sont allés s'y installer. Cela conduit à la première théorie sur Roanoke.
La théorie dominante est que puisqu'il n'y avait pas de colons trouvés près de la colonie de Roanoke, les colons ont dû l'abandonner. Quant à savoir où les colons sont allés après avoir abandonné la colonie, les chercheurs pensent que les colons ont traversé la Caroline du Nord, principalement en utilisant le détroit d'Albemarle et la rivière Chowan, et ont rejoint l'une des nombreuses tribus qu'ils ont rencontrées en cours de route.
D'autres théories sont que les colons sont tombés à cause de maladies causées par des microbes du Nouveau Monde auxquels leurs corps n'avaient jamais été exposés auparavant ou que les Amérindiens ont tué les colons. En tout cas, les chercheurs s'accordent à dire que les colons se sont séparés et cela a finalement conduit à leur disparition.
