La clé USB a été inventée en 1999. Cependant, il y a un différend sur qui l'a inventée. Alors que la société israélienne M-Systems a déposé le premier brevet en avril de la même année, leur produit impliquait un câble USB et une unité de mémoire, tandis que le brevet de septembre de Shimon Shmueli concernait une clé USB.
Deux sociétés asiatiques ont également revendiqué l'invention de la clé USB. La société singapourienne Trek Technology et la société chinoise Netac Technology ont toutes deux déposé des poursuites pour défendre leur invention présumée de l'appareil. Bien que Trek Technology ait remporté un tel procès à Singapour, leur brevet a été révoqué au Royaume-Uni. Officiellement, le brevet de la clé USB appartient à IBM.