Les organismes classés comme archébactéries ont des parois cellulaires, contiennent des acides gras, ont une ARN polymérase complexe et ont des systèmes de métabolisme. Ces caractéristiques distinguent les archébactéries des autres organismes. Certains traits, cependant, sont partagés avec des organismes d'autres règnes, y compris les eucaryotes et les bactéries.
Toutes les archaebactéries ont des parois cellulaires, mais la structure des parois varie selon les espèces. Les archaebactéries manquent de peptidoglycane, ce qui les distingue des organismes étroitement apparentés du royaume des bactéries. Les archaebactéries ont des lipides membranaires composés d'acides gras et ont une ARN polymérase complexe pour transcrire et copier des matrices d'ADN en produits d'ARN. Archae digère également en utilisant un système de métabolisme interne, qui se déroule en plusieurs étapes.
